Za mnoge uporabnike so USB ključi idealno sredstvo za dosego cilja: USB ključki so majhni, poceni in ponujajo veliko prostora za shranjevanje. Ni čudno, da se zapisuje vedno manj CD -jev in DVD -jev. Toda pri oblikovanju ključa USB je treba upoštevati nekaj stvari
USB ključe morate praviloma formatirati z datotečnim sistemom FAT32: Ta datotečni sistem ne prepoznajo samo Windows 7, Windows Vista in Windows XP, ampak tudi računalniki z Mac OS X in Linux.
Ulov FAT32 pa je, da datoteka ne sme biti večja od 4 gigabajtov. Čeprav je to oviro razmeroma težko preskočiti in jo je enostavno prebroditi, je še ena pomanjkljivost veliko pomembnejša: ključi USB imajo lahko največjo kapaciteto shranjevanja 32 gigabajtov, če jih želimo formatirati s FAT32. USB ključi z zmogljivostjo shranjevanja več kot 32 gigabajtov so trenutno še vedno relativno dragi, vendar cene še naprej padajo, zato morate upoštevati to omejitev velikosti.
ExFAT nima omejitev glede velikosti datotek ali splošne zmogljivosti shranjevanja ključa USB: Microsoft je ta datotečni sistem predstavil z operacijskim sistemom Windows 7, tako da ExFAT standardno podpira samo Windows 7. Po drugi strani pa v sistemu Windows Vista potrebujete servisni paket 1, s katerim je nadgrajena podpora ExFAT. Microsoft je izdal ločeno posodobitev za Windows XP, tako da je USB ključe z ExFAT mogoče uporabiti kot datotečni sistem: http://support.microsoft.com/kb/955704
Po drugi strani pa FAT popolnoma odsvetujemo: ta datotečni sistem je zdaj zastarel, zato ga ne smete več uporabljati. NTFS ima tudi številne pomanjkljivosti, saj lahko sistemi z operacijskim sistemom Mac OS X na splošno berejo takšne ključe USB, vendar nanje ne morejo zapisati datotek.
